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MDO1 - Introduction aux méthodes de séquençage NGS et applications en génomique, métagénomique et transcriptomique Mixte : présentiel / à distance

Dernière mise à jour : 17/04/2023

Bannière visuelle de présentation de la formation

Description

De nombreux projets d'analyse de données OMICs s'appuient aujourd'hui sur les possibilités de production haut-débit apportées par les nouvelles technologies de séquençage. Soladis vous invite à participer à cette formation introductive aux projets de Next Generation Sequencing (NGS) qui a pour objectif de vous donner un aperçu du principe et des applications de ces nouvelles méthodes de séquençage en OMICs

Domaine : COSMETIQUES SANTE, BIOTECH, AGROALIMENTAIRE, ENVIRONNEMENT

Objectifs de la formation

  • Comprendre le principe des méthodes de séquençage nouvelle génération
  • Explorer les applications NGS autour des problématiques OMICs
  • Favoriser les interactions avec les bioinformaticiens

Public visé

Métiers ayant des bases en biologie : Biologistes, biostatisticiens, chargés de projets de tous secteurs.

Prérequis

Aucun

Programme

1. INTRODUCTION

  • Historique du séquençage : Du Sanger au Single Cell
  • Evolution des applications en big data

 

 

2. COMPRENDRE LES CONCEPTS DES SÉQUENÇAGES NGS

  • Comprendre les différentes méthodes de séquençage
  • Appréhender les caractéristiques d'un séquençage : temps de séquençage, longueur de reads, profondeur, choix des librairies…

 

 

3. TRAITEMENT DES DONNÉES DE SÉQUENÇAGE

  • Comprendre les sorties brutes des séquenceurs
  • Assurer un contrôle qualité des données
  • Analyse des données du génome : assemblage de novo vs mapping
  • Aperçu des principales bases de données

 

 

EXEMPLES D'APPLICATIONS DES NGS

  • Epidémiologie bactérienne et génomique comparative
  • Analyse différentielle en oncologie et recherche de signatures
  • Métagénomique ciblée en cosmétologie
  • Métagénomique fonctionnelle du microbiote intestinal

Modalités pédagogiques

•  Partage et discussion autour d'exemples d'application

•  Alternance d'exposés, de discussions avec le formateur et entre participants.

•  Nombreux cas pratiques directement applicables après la formation.

•  Remise des supports pédagogiques

•  Vidéo projection du support PowerPoint.

Modalités d'évaluation et de suivi

  • Evaluation de début et fin de formation.
  • Evaluation de la satisfaction en fin de formation.

Infos complémentaires

Bases en biologie nécessaires

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Pour toutes informations complémentaires nous conseillons les structures suivantes AGEFIPH (www.agefiph.fr), FIPHFP(www.fiphfp.fr). Nous tenons également une liste de partenaires mobilisables le cas échéant.

All our training sessions are accessible to individuals with disabilities. As each situation is unique, we kindly ask our clients to specify the disability when making inquiries. This allows us to confirm all possible accommodations and enables participants to undergo training under the best conditions.

For further information, we recommend the following organizations: AGEFIPH (www.agefiph.fr), FIPHFP (www.fiphfp.fr). We also maintain a list of partners who can be mobilized if necessary.



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Prochaines Sessions

  • 14/05/24 → 15/05/24 À distance
    Classe virtuelle

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