Introduction aux méthodes de séquençage NGS et applications en génomique, métagénomique et transcriptomique
Dernière mise à jour : 25/06/2026
Description
De nombreux projets d'analyse de données OMICs s'appuient aujourd'hui sur les possibilités de production haut-débit apportées par les nouvelles technologies de séquençage. Soladis vous invite à participer à cette formation introductive aux projets de Next Generation Sequencing (NGS) qui a pour objectif de vous donner un aperçu du principe et des applications de ces nouvelles méthodes de séquençage en OMICs
Domaine : COSMETIQUES SANTE, BIOTECH, AGROALIMENTAIRE, ENVIRONNEMENT
Objectifs de la formation
- Comprendre le principe des méthodes de séquençage nouvelle génération
- Explorer les applications NGS autour des problématiques OMICs
- Favoriser les interactions avec les bioinformaticiens
Public visé
Métiers ayant des bases en biologie : Biologistes, biostatisticiens, chargés de projets de tous secteurs.
Prérequis
Aucun
Programme
1. INTRODUCTION
- Historique du séquençage : Du Sanger au Single Cell
- Evolution des applications en big data
2. COMPRENDRE LES CONCEPTS DES SÉQUENÇAGES NGS
- Comprendre les différentes méthodes de séquençage
- Appréhender les caractéristiques d'un séquençage : temps de séquençage, longueur de reads, profondeur, choix des librairies…
3. TRAITEMENT DES DONNÉES DE SÉQUENÇAGE
- Comprendre les sorties brutes des séquenceurs
- Assurer un contrôle qualité des données
- Analyse des données du génome : assemblage de novo vs mapping
- Aperçu des principales bases de données
EXEMPLES D'APPLICATIONS DES NGS
- Epidémiologie bactérienne et génomique comparative
- Analyse différentielle en oncologie et recherche de signatures
- Métagénomique ciblée en cosmétologie
- Métagénomique fonctionnelle du microbiote intestinal
Modalités pédagogiques
• Partage et discussion autour d'exemples d'application
• Alternance d'exposés, de discussions avec le formateur et entre participants.
• Nombreux cas pratiques directement applicables après la formation.
• Remise des supports pédagogiques
• Vidéo projection du support PowerPoint.
Modalités d'évaluation et de suivi
- Evaluation de début et fin de formation.
- Evaluation de la satisfaction en fin de formation.
Infos complémentaires
Bases en biologie nécessaires